要将环氧乙烷灭菌器出口到日本并进行PMDA（Pharmaceuticals and Medical Devices Agency）认证，您可以按照以下步骤进行办理：

1.      了解PMDA认证要求：详细了解日本PMDA对医疗器械的认证要求，包括技术和质量标准、文件要求以及申请流程。确保您了解适用的法规和要求，并准备满足这些要求的申请材料。

2.      委托当地代理人：根据日本的法规要求，作为国外企业，您需要委托一个在日本注册的本地代理人代表您与PMDA进行沟通和协调。这个本地代理人将协助您进行申请和认证的流程。

3.      准备申请材料：根据PMDA的要求，准备申请所需的材料。这可能包括产品规格、技术文件、性能测试报告、质量管理体系文件、标签和说明书等。确保所有文件符合PMDA的要求，并提供充分的证据以证明产品的合规性和安全性能。

4.      提交申请：将申请材料提交给PMDA，并支付相应的申请费用。您的本地代理人将协助您填写必要的表格和文件，并确保所有文件的完整性和准确性。

5.      审核和评估：PMDA将对您的申请进行审核和评估。他们可能会对文件进行审查，并可能要求进一步的信息或补充材料。他们将评估您的产品是否符合日本的技术和安全要求。

6.      完善文件和合规性：根据PMDA的要求和反馈，进行必要的修改和改进，确保文件和产品符合PMDA认证的要求。可能需要进行产品设计的调整、文件的更新以及质量管理体系的改进等。

7.      获得PMDA认证：如果您的产品通过了PMDA的审核和评估，并且文件和合规性得到认可，您将获得PMDA认证。这将证明您的环氧乙烷灭菌器符合日本的医疗器械要求，并可以在日本市场上销售和使用。