办理内镜清洗消毒器的MDR CE认证（欧洲医疗器械监管）涉及以下步骤和流程：

1. 了解CE认证要求：首先，您需要熟悉欧洲医疗器械监管的相关要求，特别是新的医疗器械法规（Medical Device Regulation，MDR）的要求。确保您的内镜清洗消毒器符合适用的技术要求、安全性要求和性能要求等。

2. 选择合适的认证机构：选择一家合适的认证机构，通常是认可的第三方机构，负责对您的内镜清洗消毒器进行认证评估和审核。确保所选机构有MDR的认可资质。

3. 制定技术文件：准备必要的技术文件，包括产品说明、技术规格、设计文件、材料清单、性能验证报告、安全性评价报告等。这些文件应符合MDR的要求，并详细描述内镜清洗消毒器的设计和功能特点。

4. 进行风险评估：根据MDR要求，进行内镜清洗消毒器的风险评估，识别潜在风险，并采取适当的风险控制措施，确保产品的安全性和有效性。

5. 进行性能验证和临床评价：进行产品性能验证测试，以确保内镜清洗消毒器的性能指标符合要求。根据产品的等级和分类，可能需要进行相关的临床评价。

6. 编制技术文件和申请：基于前面的工作，编制完整的技术文件，并向认证机构提交认证申请。申请中应包含所有必要的文件和信息，以证明内镜清洗消毒器符合MDR的要求。

7. 认证评估和审核：认证机构将对技术文件进行评估和审核，可能会进行现场审查、文件审查、测试和检验等。他们将验证您的内镜清洗消毒器是否符合MDR的要求。

8. 发放CE认证证书：如果您的内镜清洗消毒器通过了认证机构的评估和审核，认证机构将颁发CE认证证书。该证书确认您的产品符合MDR的要求，并有权在欧洲市场上销售和使用。