要在国内办理内镜清洗消毒系统的械字号注册，您可以按照以下步骤进行办理：

1. 准备材料：收集和准备申请所需的文件和材料，包括但不限于产品说明、技术文件、性能测试报告、质量管理体系文件、临床试验数据（如果适用）等。您需要确保文件和材料符合国家药品监督管理局（NMPA）的要求。

2. 委托代理商：根据中国的要求，通常需要委托国内的注册代理商来代表您进行申请和审批过程。注册代理商将帮助您处理相关文件、沟通和协调与NMPA的事宜。

3. 提交申请：通过您的国内注册代理商，向NMPA提交械字号注册申请。注册代理商将协助您填写申请表格，并确保文件符合NMPA的要求。

4. 审核和评估：NMPA将对您的申请进行审核和评估，包括对技术文件、性能数据和质量管理体系的审查。他们可能会要求补充信息或进行现场审核。

5. 批准和颁发械字号：如果您的申请符合要求并通过审核，NMPA将批准并颁发内镜清洗消毒系统的械字号注册证书，证明您的产品符合国内市场的要求。